正在如火如荼升级的增值税发票管理系统2.0版将于11月1日正式启用，发票系统2.0版集成了税控系统、电子底账系统及综合服务平台（包括税务版和企业版），优化升级了原增值税发票选择确认平台和发票查验平台，为纳税人提供了增值税发票的网上抵扣勾选、退税勾选、代办退税勾选、进项发票查询、成品油消费税管理和进销项发票下载等功能，功能更加完善、界面更加友好。

1、发票系统2.0上线后，企业通过自助办税终端和扫描认证仪认证发票，需要“确认签名”来完成操作。通过“自助办税终端和扫描认证仪”认证的发票，在新上线的“综合服务平台”默认勾选为抵扣用途，需要选择工具栏“抵扣勾选”项目下的抵扣勾选统计页面，在弹出的页面右方点击“确认签名”按钮即可。在系统要求用户再次输入证书密码时需要插盘进行用户身份的再次确认。

2、所有一般纳税人取得增值税专用发票、机动车销售统一发票、通行费增值税电子普通发票均可以自愿选择使用增值税发票选择确认平台。

3、D级纳税人也可以使用网上勾选发票功能。

4、新增勾选认证数据会触发报表更新，数据延迟可忽略不计。

5、可对勾选发票的有效金额进项编辑。企业实际操作中存在很多情况，时常有一张发票上既有允许抵扣的，又有不允许抵扣税款的，以前的做法是，先整张认证后，再做进项税额转出。2.0版有“可更改有效税额”功能，对勾选发票，有效税额转变为可编辑状态，系统默认的有效税额为发票税额，纳税人可修改并输入实际发生的有效税额，输入的有效税额大于零但小于或等于发票税额。但要注意该张发票的剩余税额（税额-有效税额）不支持再次勾选。有“可更改有效税额”功能后，纳税人只需抵扣输入的实际发生的有效税额，不用再做进项税额转出。

6、发票可以导出处理后，再直接导入。“抵扣勾选—发票批量抵扣勾选”模块可以通过文件导入的形式实现批量勾选，达到提高发票勾选效率、降低勾选工作量的目的。本功能是针对发票数据量较大、逐票勾选模式不太适用的纳税人提供的一项优化服务

7、有“发票下载”功能。可根据业务需要自行申请并下载本企业开具的和取得的增值税发票。本功能模块包含发票下载、发票查询等功能。

8、增值税普通发票也能通过这里查询。点击“发票查验”，系统自动跳转到“国家税务总局全国增值税发票查验平台”。因此， “国家税务总局全国增值税发票查验平台”支持查询的发票都可以在综合服务平台实现查询。

9、实现撤销勾选：对前次发票勾选操作的撤销处理，即将已勾选的发票重新转变为未勾选状态。

10、实现注销勾选。纳税人办理注销税务登记，在完成当期税款所属期申报后，允许对下一税款所属期发票数据的勾选确认。例如当前月份为11月，当期税款所属期为10月，在完成当期税款所属期申报10月份的勾选后，可以对进一步对下一税款所属期为11月的发票进行勾选，从而可以进一步完成下一税款所属期的注销申报。